Ligamenvirales

Эта статья находится на начальном уровне проработки, в одной из её версий выборочно используется текст из источника, распространяемого под свободной лицензией
Материал из энциклопедии Руниверсалис
Ligamenvirales

Вирион рода Betalipothrixvirus
Научная классификация
Группа:
Реалм:
Царство:
Zilligvirae
Тип:
Taleaviricota
Класс:
Порядок:
Ligamenvirales
Международное научное название
Ligamenvirales
Группа по Балтимору
I: дцДНК-вирусы

Ligamenvirales — это отряд линейных вирусов, которые заражают архей типа Thermoproteota (ранее Crenarchaeota) и имеют двухцепочечные ДНК-геномы[2]. Отряд был предложен Давидом Прангишвили и Мартом Круповичем в 2012 году и впоследствии создан Международным комитетом по систематике вирусов (ICTV).

Название происходит от латинского ligamen, что означает струна или нить.

Классификация

В этом отряде есть два семейства — Lipothrixviridae и Rudiviridae.

Вироны нитевидные со спиральным нуклеокапсидом. На обоих концах прикреплены либо ворсинки, либо более сложные структуры, участвующие в адгезии к клетке-хозяину.

Основные белки оболочки как липотриксвирусов, так и рудивирусов имеют необычную топологию пучка из четырёх спиралей[3][4][5][6]. Геном представляет собой несегментированную линейную двухцепочечную ДНК. Вирусы из этих двух семейств имеют до десяти общих генов. Основное различие между этими двумя семействами заключается в том, что члены семейства Rudiviridae не покрыты оболочкой, в то время как нуклеокапсиды липотриксвирусов окружены липидной мембраной. Кроме того, в то время как капсид рудивирусов состоит из одного основного капсидного белка, капсид липотриксвирусов образован из двух паралогичных основных капсидных белков. В обеих группах вирусов основные капсидные белки образуют когтеобразный димер (гомодимер у рудивирусов и гетеродимер у липотриксвирусов), который оборачивается вокруг дцДНК.

Представители Ligamenvirales структурно связаны с архейными вирусами семейства Tristromaviridae, которые, подобно липотриксвирусам, кодируют два паралогичных основных капсидных белка с той же складкой, что и у лигаменвирусов[7]. Из-за этих структурных сходств отряд Ligamenvirales и семейство Tristromaviridae было предложено объединить в класс «Tokiviricetes» (toki означает «нить» на грузинском языке, а viricetes — официальный суффикс для класса вирусов)[7].

На март 2020 года в порядок включают 2 семейства и 5 родов[8]:

У представителей отряда имеется до 10 общих генов.

Примечания

  1. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
  2. Prangishvili D (2012). «A new proposed taxon for double-stranded DNA viruses, the order Ligamenvirales». Arch Virol 157 (4): 791–795. doi:10.1007/s00705-012-1229-7. PMID 22270758.
  3. Goulet A, Blangy S, Redder P, Prangishvili D, Felisberto-Rodrigues C, Forterre P, Campanacci V, Cambillau C (2009) Acidianus filamentous virus 1 coat proteins display a helical fold spanning the filamentous archaeal viruses lineage. PNAS 106 (50) 21155-60
  4. (2015) «Virology. A virus that infects a hyperthermophile encapsidates A-form DNA.». Science 348 (6237): 914–7. doi:10.1126/science.aaa4181. PMID 25999507.
  5. (2017) «Model for a novel membrane envelope in a filamentous hyperthermophilic virus.». eLife 6: e26268. doi:10.7554/eLife.26268. PMID 28639939.
  6. (2018) «Structural conservation in a membrane-enveloped filamentous virus infecting a hyperthermophilic acidophile.». Nature Communications 9 (1): 3360. doi:10.1038/s41467-018-05684-6. PMID 30135568. Bibcode2018NatCo...9.3360L.
  7. Перейти обратно: 7,0 7,1 (2020) «Structure of a filamentous virus uncovers familial ties within the archaeal virosphere». Virus Evolution 6 (1): veaa023. doi:10.1093/ve/veaa023. PMID 32368353.
  8. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV)(Дата обращения: 24 апреля 2020).