Herelleviridae
Herelleviridae | |
---|---|
Бактериофаг Schiekvirus EfV12, масштабная черта — 100 нм | |
Научная классификация | |
Реалм: Царство: Тип: Uroviricota Класс: Caudoviricetes Семейство: Herelleviridae |
|
Международное научное название | |
Herelleviridae | |
Группа по Балтимору | |
I: дцДНК-вирусы | |
Herelleviridae — семейство вирулентных бактериофагов с миовирусной морфологией.
История
В 2000-х годах развитие методов геномного анализа позволило выявить гетерогенность классических семейств бактериофагов, выделенных на основе морфологических признаков вирусных частиц[2][3]. В 2009 году Роб Лавин и Эндрю Кропински с соавторами осуществили кластеризацию белковых последовательностей бактериофагов с миовирусной морфологией и предложили подсемейство Spounavirinae в составе семейства Myoviridae. На основании результатов комплексного анализа геномных последовательностей, в 2020 году коллектив авторов в составе Якуба Барыльского, Эвелин Адриансенс и 19 других членов Международного комитета по таксономии вирусов описал сходное по составу семейство Herelleviridae. Названное в честь столетней годовщины открытия вирусов прокариот Феликсом д’Эреллем, оно стало вторым после Ackermannviridae семейством бактериофагов, описанным по результатам биоинформационного анализа общих генов[4][5].
Характеристика
В 2021 году семейство Herelleviridae включало в себя 34 рода бактериофагов. Из них наиболее объёмными были Kayvirus и Pecentumvirus c 11 видами в каждом, а также Bequatrovirus, Caeruleovirus, Harbinvirus и Wphvirus с пятью-шестью видами[6]. Размер капсидов составляет 78—100 нм. Белок хвостовой оболочки состоит из двух или трёх доменов[7]. Размер геномов варьирует в пределах 102—167 т. п. н.[8]. Концы геномов организованы в виде длинных повторов протяжённостью 2—16 т. п. н. Репликация осуществляется при помощи кодируемой геномом фага ДНК-полимеразы. Хозяевами являются бактерии типа Firmicutes[9]. Продолжительность латентного периода в жизненном цикле может составлять от 10 до 50 минут[10][11][12]. Диапазон действия у представителей Kayvirus, инфицирующих Staphylococcus aureus, — от 60% до более чем 95% протестированных изолятов[13]. Schiekvirus EfV12 является примером бактериофага, способного размножаться на культурах двух различных видов энтерококков[14].
Практическое значение
В 1997—2014 годах представители родов Kayvirus, Kochikohdavirus и Schiekvirus входили в состав препарата Пиобактериофаг института имени Георга Элиавы[15].
Примечания
- ↑ Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
- ↑ (2021) «A roadmap for genome-based phage taxonomy». Viruses 13 (3): 506. doi:10.3390/v13030506. PMID 33803862.
- ↑ Савич В. В., Сидоренко А. В. Некоторые аспекты современной систематики бактериофагов // Микробные биотехнологии: фундаментальные и прикладные аспекты : Сборник научных трудов. — Минск: Республиканское унитарное предприятие "Издательский дом "Белорусская наука", 2021. — Т. 13. — С. 83–102. — doi:10.47612/2226-3136-2021-13-83-102.
- ↑ (2009) «Classification of Myoviridae bacteriophages using protein sequence similarity». BMC Microbiology 9: 224. doi:10.1186/1471-2180-9-224. PMID 19857251.
- ↑ Virus Taxonomy: 2021 Release . International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Дата обращения: 18 января 2023.
- ↑ (2022) «Evolution of phage tail sheath protein». Viruses 14 (6): 1148. doi:10.3390/v14061148. PMID 35746620.
- ↑ [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/?term=txid2560065[Organism:exp] Nucleotide Database] . National Library of Medicine. Дата обращения: 2023-18-01.
- ↑ (2020) «ICTV Virus Taxonomy Profile: Herelleviridae». The Journal of General Virology 101 (4): 362–363. doi:10.1099/jgv.0.001392. PMID 32022658.
- ↑ (2022) «Insights into gene transcriptional regulation of Kayvirus bacteriophages obtained from therapeutic mixtures». Viruses 14 (3): 626. doi:10.3390/v14030626. PMID 35337034.
- ↑ (2022) «APTC-C-SA01: A novel bacteriophage cocktail targeting Staphylococcus aureus and MRSA biofilms». International Journal of Molecular Sciences 23 (11): 6116. doi:10.3390/ijms23116116. PMID 35682794.
- ↑ (2022) «Two novel lytic bacteriophages infecting Enterococcus spp. are promising candidates for targeted antibacterial therapy». Viruses 14 (4): 831. doi:10.3390/v14040831. PMID 35458561.
- ↑ (2018) «Metagenome analysis of Russian and Georgian Pyophage cocktails and a placebo-controlled safety trial of single phage versus phage cocktail in healthy Staphylococcus aureus carriers». Environmental Microbiology 20 (9): 3278–3293. doi:10.1111/1462-2920.14310. PMID 30051571.
- ↑ (2019) «Predictable molecular adaptation of coevolving Enterococcus faecium and lytic phage EfV12-phi1». Frontiers in Microbiology 9: 3192. doi:10.3389/fmicb.2018.03192. PMID 30766528.
- ↑ (2017) «Metagenomic analysis of therapeutic PYO phage cocktails from 1997 to 2014». Viruses 9 (11): 328. doi:10.3390/v9110328. PMID 29099783.