Уэббер привел баскетбольную команду школы Country Day к трём чемпионским титулам MHSAA State. В выпускном классе он в среднем набирал 29,4 очка и 13 подборов за игру. Он был назван Мистером Баскетбол Мичигана, а в сезоне 1990/91 игроком года США среди школьников. Он стал самым ценным игроком матчей всех звёзд McDonald и Dan All.
Мичиган Вулверинс
По окончании школы Уэббер вступил в Мичиганский университет, где проучился 2 года. Во время выступления за «Мичиган Вулверинс» Уэббер возглавлял группу игроков, которую назвали Fab Five в которую кроме него входили Джувэн Ховард, Джален Роуз, Джимми Кинг и Рэй Джексон. Эта группа, придя в университет в 1991 году привела «Вулверинс» к двум финалам чемпионата NCAA, где проиграли дважды. Fab Five стали популярны среди болельщиков. Четверо из этой группы впоследствии попали в НБА.
В своём дебютном сезоне Уэббер в среднем за игру набирал 17,5 очка, делал 9,1 подбора и по итогам чемпионата стал новичком года НБА и помог команде выйти в плей-офф. Однако у Уэббера сложились плохие отношения с главным тренером клуба Доном Нельсоном[1], который хотел, чтобы тот играл под кольцом, самому же Крису больше нравилось идти в проходы и раздавать пассы. Ему также не нравилось играть на позиции центрового. В межсезонье 1994 года Голден Стэйт пополнились центровым Рони Сейкали и Крис стал больше играть на позиции тяжёлого форварда. Однако разногласия между Уэббером и Нельсоном так и остались неразрешёнными и игрок решил не продлевать контракт с «Уорриорз» и клуб решил обменять его в «Вашингтон Буллетс» на Тома Гуглиотту и три выбора в первом раунде.
