Jmol
| Jmol | |
|---|---|
mol_logo_2013.svg){kind=logo} | |
 Jmol — Java программа для визуализации трёхмерных молекулярных структур | |
| Тип | Биоинформатика |
| Разработчик | Команда разработчиков Jmol |
| Написана на | Java |
| Операционная система | Кроссплатформенный |
| Языки интерфейса | каталанский, китайский, чешский, немецкий, английский, французский, нидерландский, венгерский, итальянский, корейский, португальский, испанский, турецкий, русский |
| Последняя версия | 14.31.18 (19 ноября 2020) |
| Лицензия | LGPL |
| Сайт | jmol.org |
Jmol — программа для просмотра структуры молекул в трёх измерениях.
Jmol используется как для учебных целей[1], так и при проведении научных исследований в области молекулярной биологии, химии и биохимии. Программа является свободной и открытой. Она написана на языке Java и потому является кроссплатформенной. Существует как отдельная программа, так и средства для интеграции в другое Java-приложение. Чаще всего программа используется как аплет, встраиваемый в веб-страницу. Программа позволяет строить изображения молекул несколькими способами. Jmol поддерживает большое количество форматов файлов, включая:
- Protein Data Bank (pdb)
- Crystallographic Information File (cif)
- MDL Molfile (mol)
- Chemical Markup Language (CML)
- Chemical File Format (XYZ).
Скриншоты
-
Кристаллическая структура H/ACA коробки RNP из архебактерии Pyrococcus furiosus.
-
Подсвечивание двух солевых мостиков в тетрамере гемоглобина (гемо-группа изображена палочками в нижнем правом углу).
-
Фрагмент транскрипционного фактора TFIIIA, образующего три последовательных цинковых пальца, присоединённых к последовательности ДНК.
-
70S-субъединица рибосомы из эубактерии Thermus thermophilus.
Ссылки
См. также
Примечания
- ↑ A. Herraez. Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue (англ.) // Biochemistry and Molecular Biology Education. — 2006. — Vol. 34, no. 4. — P. 7. Архивировано 31 мая 2020 года.