PUMA (белок)

PUMA
PUMA
	; Взаимодействие ВН3 домена PUMA с гидрофобным карманом Bcl-xL
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	2M04, 4BPI, 4BPJ, 4BPK, 4HNJ
Идентификаторы
Символ	BBC3 ; JFY-1; JFY1; PUMA
Внешние ID	OMIM: 605854 MGI: 2181667 HomoloGene: 8679 ChEMBL: 1250409 GeneCards: BBC3 Gene
Генная онтология
Генная онтология
Функция	• protein binding;
Компонент клетки	• mitochondrion; • mitochondrial outer membrane; • endoplasmic reticulum; • cytosol;
Биологический процесс	• release of cytochrome c from mitochondria; • apoptotic process; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • cellular response to DNA damage stimulus; • determination of adult lifespan; • programmed cell death; • positive regulation of protein homooligomerization; • negative regulation of endoplasmic reticulum calcium ion concentration; • response to endoplasmic reticulum stress; • positive regulation of neuron apoptotic process; • negative regulation of growth; • release of sequestered calcium ion into cytosol; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress; • positive regulation of thymocyte apoptotic process; • cellular response to hypoxia; • positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria; • apoptotic signaling pathway; • intrinsic apoptotic signaling pathway; • execution phase of apoptosis; • positive regulation of protein insertion into mitochondrial membrane involved in apoptotic signaling pathway; • positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway; • positive regulation of IRE1-mediated unfolded protein response; • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity; • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway;
	Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи

PUMA (англ. p53 upregulated modulator of apoptosis) — про-апоптотический протеин из семейства Bcl-2.

Структура

PUMA входит в семейство регуляторных белков Bcl-2, подсемейство только-BH3. Данное подсемейство характеризуется наличием у протеинов одного домена BH3, который необходим для взаимодействия с другими протеинами семейства, такими как Bcl-2 и Bcl-xL^[1]. Митохондриальная локализация PUMA обусловлена наличием гидрофобного домена в С-терминальной части протеина^[2].

Функции

Биохимические исследования показали, что PUMA образует комплекс с антиапоптотическими протеинами семейства Bcl-2 такими как Bcl-xL, Bcl-2, Mcl-1, Bcl-w и A1. Образование комплекса ингибирует их взаимодействие с проапоптотическими белками Bax и Bak. Последние способны к транслокации в митохондрии где они взаимодействуют с потенциал-зависимыми анионными каналами, увеличивая их проводимость, и соответственно меняя мембранный потенциал. Изменения мембранного потенциала митохондрий приводит к высвобождению митохондриальных апоптогенов, таких как Цитохром c, SMAC, AIF, и запуску каспазного каскада, что в конечном итоге вызывает клеточную гибель^[3].

Активация

В большинстве случаев, процесс PUMA-индуцированного апоптоза регулируется на уровне транскрипции при помощи транскрипционного фактора p53. В свою очередь, активация р53 может быть вызвана различными факторами, например, понижением уровня глюкозы или повреждениями ДНК^[4].

Примечания

↑ Day C.L., Smits C., Fan F.C., Lee E.F., Fairlie W.D., Hinds M.G. Structure of the BH3 domains from the p53-inducible BH3-only proteins Noxa and Puma in complex with Mcl-1 (англ.) // J. Mol. Biol. (англ.) (рус. : journal. — 2008. — July (vol. 380, no. 5). — P. 958—971. — doi:10.1016/j.jmb.2008.05.071. — PMID 18589438.
↑ Yu J., Wang Z., Kinzler K.W., Vogelstein B., Zhang L. PUMA mediates the apoptotic response to p53 in colorectal cancer cells (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — February (vol. 100, no. 4). — P. 1931—1936. — doi:10.1073/pnas.2627984100. — PMID 12574499.
↑ Nakano K., Vousden K.H. PUMA, a novel proapoptotic gene, is induced by p53 (англ.) // Mol. Cell (англ.) (рус. : journal. — 2001. — March (vol. 7, no. 3). — P. 683—694. — doi:10.1016/S1097-2765(01)00214-3. — PMID 11463392.
↑ Zhao Y., Coloff J.L., Ferguson E.C., Jacobs S.R., Cui K., Rathmell J.C. Glucose metabolism attenuates p53 and Puma-dependent cell death upon growth factor deprivation (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2008. — December (vol. 283, no. 52). — P. 36344—36353. — doi:10.1074/jbc.M803580200. — PMID 18990690.

[pmid18589438-1] Day C.L., Smits C., Fan F.C., Lee E.F., Fairlie W.D., Hinds M.G. Structure of the BH3 domains from the p53-inducible BH3-only proteins Noxa and Puma in complex with Mcl-1 (англ.) // J. Mol. Biol. (англ.) (рус. : journal. — 2008. — July (vol. 380, no. 5). — P. 958—971. — doi:10.1016/j.jmb.2008.05.071. — PMID 18589438.

[pmid12574499-2] Yu J., Wang Z., Kinzler K.W., Vogelstein B., Zhang L. PUMA mediates the apoptotic response to p53 in colorectal cancer cells (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — February (vol. 100, no. 4). — P. 1931—1936. — doi:10.1073/pnas.2627984100. — PMID 12574499.

[pmid11463392-3] Nakano K., Vousden K.H. PUMA, a novel proapoptotic gene, is induced by p53 (англ.) // Mol. Cell (англ.) (рус. : journal. — 2001. — March (vol. 7, no. 3). — P. 683—694. — doi:10.1016/S1097-2765(01)00214-3. — PMID 11463392.

[pmid18990690-4] Zhao Y., Coloff J.L., Ferguson E.C., Jacobs S.R., Cui K., Rathmell J.C. Glucose metabolism attenuates p53 and Puma-dependent cell death upon growth factor deprivation (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2008. — December (vol. 283, no. 52). — P. 36344—36353. — doi:10.1074/jbc.M803580200. — PMID 18990690.

[1]

[2]

[3]

[4]