Активатор апоптоза harakiri
Активатор апоптоза harakiri (HRK) — белок семейства Bcl2, активатор апоптоза, который у человека кодируется геном HRK.
Структура гена, мРНК и белка
кДНК HRK была впервые независимо клонирована из клеток HeLa и симпатических нейронов крыс в 1997 году[1][2]. кДНК HRK человека имела длину около 700 нуклеотидов и включала 5'- и 3'-некодирующие области, кодирующую область и поли(А)-хвост. В 3'-некодирующей области был обнаружен сигнал дестабилизации мРНК 5'-ATTTA-3'[1].
Ген HRK кодирует белок длиной в 91 аминокислотный остаток. Гомологи HRK по первичной структуре пока не обнаружены. Фрагмент 37—44 гомологичен домену BH3 (англ. Bcl-2 homology domain 3)[1].
Распространение и внутриклеточная локализация
Методом нозерн-блота мРНК HRK была обнаружена в лимфоидных органах, особенно в селезёнке и костном мозге, а также в поджелудочной железе человека[1]. Хотя методом полногеномного секвенирования РНК присутствие мРНК HRK в селезёнке и костном мозге выявить не удалось, небольшие её количества были обнаружены в лимфатических узлах, коре головного мозга, щитовидной железе, надпочечниках и тестикулах[3].
мРНК HRK была обнаружена только в головном мозге взрослых крыс и отсутствовала в селезёнке, тимусе, тестикулах, тонком кишечнике, сердечной и скелетных мышцах[2].
Методом иммуногистохимии низкие и средние количества белка Hrk были обнаружены во многих органах, при этом препараты тонкого кишечника, поджелудочной железы, кожи, молочных желёз и лимфоидных тканей имели, как правило, отрицательную окраску (белок отсутствует)[3].
В клетках HRK локализуется преимущественно в митохондриях и взаимодействует там с белком митохондриального матрикса p32[4].
Примечания
- ↑ Перейти обратно: 1,0 1,1 1,2 1,3 Inohara N., Ding L., Chen S., Núñez G. harakiri, a novel regulator of cell death, encodes a protein that activates apoptosis and interacts selectively with survival-promoting proteins Bcl-2 and Bcl-X(L) // EMBO J. — 1997. — Vol. 16, № 7. — P. 1686—94. — PMID 9130713.
- ↑ Перейти обратно: 2,0 2,1 Imaizumi K., Tsuda M., Imai Y., Wanaka A., Takagi T., Tohyama M. Molecular cloning of a novel polypeptide, DP5, induced during programmed neuronal death // J Biol Chem. — 1997. — Vol. 272, № 30. — P. 18842—8. — PMID 9228060.
- ↑ Перейти обратно: 3,0 3,1 HRK в базе данных The Human Protein Atlas. Дата обращения: 7 апреля 2014. Архивировано 9 апреля 2014 года.
- ↑ Sunayama J., Ando Y., Itoh N., Tomiyama A., Sakurada K., Sugiyama A., Kang D., Tashiro F., Gotoh Y., Kuchino Y., Kitanaka C. Physical and functional interaction between BH3-only protein Hrk and mitochondrial pore-forming protein p32 // Cell Death Differ. — 2004. — Vol. 11, № 7. — P. 771—81. — PMID 15031724.