Гистондеацетилаза 11

Гистондеацетилаза 11
Гистондеацетилаза 11
Идентификаторы
Символ	HDAC11 ; HD11
Внешние ID	OMIM: 607226 MGI: 2385252 HomoloGene: 11743 IUPHAR: ChEMBL: 3310 GeneCards: HDAC11 Gene
номер EC	3.5.1.98
Генная онтология
Генная онтология
Функция	• histone deacetylase activity; • transcription factor binding; • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific); • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K9 specific); • NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific); • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K18 specific);
Компонент клетки	• histone deacetylase complex; • nucleus; • plasma membrane; • extracellular vesicular exosome;
Биологический процесс	• transcription, DNA-templated; • regulation of transcription, DNA-templated; • oligodendrocyte development; • chromatin modification; • histone deacetylation; • histone H3 deacetylation; • histone H4 deacetylation;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Гистондеацетилаза 11 (англ. Histone deacetylase 11) — фермент массой 39 кДа, кодируеммый у человека геном HDAC11, расположен на хромосоме 3 у человека и на хромосоме 6 у мышей^[1]^[2].

Он является IV классом HDAC. (Класс IV имеют характеристики как класса I, так и класса II HDAC). Впервые он был описан в 2002 году.

Гистондеацетилазы, такие как HDAC11, контролируют экспрессию ДНК путём модификации октамерного ядра гистонов, что упаковывает ДНК в плотные структуры хроматина и подавляют экспрессию генов^[2].

Функции

HDAC11 экспрессируется обычно в мозгу и тканях яичка, но повышенная экспрессия HDAC11 также была замечена в различных раковых клетках.

HDAC11 был показан в качестве негативного регулятора производства IL-10 в клетках, представляющих антигены. Кроме того, было выявлено, что ингибирование HDAC11 приводит к повышенной экспрессии OX40L в клетках лимфомы Ходжкина.

Взаимодействия

HDAC11, как было выявлено, взаимодействует с HDAC6^[3].

См также

Деацетилазы гистонов

Примечания

↑ Gao L., Cueto M.A., Asselbergs F., Atadja P. Cloning and functional characterization of HDAC11, a novel member of the human histone deacetylase family (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — July (vol. 277, no. 28). — P. 25748—25755. — doi:10.1074/jbc.M111871200. — PMID 11948178.
↑ ^2,0 ^2,1 Entrez Gene: HDAC11 histone deacetylase 11 (неопр.).
↑ Gao, Lin; Cueto Maria A; Asselbergs Fred; Atadja Peter. Cloning and functional characterization of HDAC11, a novel member of the human histone deacetylase family (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — United States, 2002. — July (vol. 277, no. 28). — P. 25748—25755. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M111871200. — PMID 11948178.

Литература

Verdin E., Dequiedt F., Kasler H.G. Class II histone deacetylases: versatile regulators (англ.) // Trends^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 19, no. 5. — P. 286—293. — doi:10.1016/S0168-9525(03)00073-8. — PMID 12711221.
Hartley J.L., Temple G.F., Brasch M.A. DNA Cloning Using In Vitro Site-Specific Recombination (англ.) // Genome Research^[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 10, no. 11. — P. 1788—1795. — doi:10.1101/gr.143000. — PMID 11076863.
Simpson JC; Wellenreuther R; Poustka A; Pepperkok, R; Wiemann, S. Systematic subcellular localization of novel proteins identified by large-scale cDNA sequencing (англ.) // EMBO Reports^[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 1, no. 3. — P. 287—292. — doi:10.1093/embo-reports/kvd058. — PMID 11256614.
Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; Derge, JG; Klausner, RD; Collins, FS; Wagner, L; Shenmen, CM; Schuler, G.D. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932.
Ota T; Suzuki Y; Nishikawa T; Otsuki, Tetsuji; Sugiyama, Tomoyasu; Irie, Ryotaro; Wakamatsu, Ai; Hayashi, Koji; Sato, Hiroyuki. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
Gerhard DS; Wagner L; Feingold EA; Shenmen, CM; Grouse, LH; Schuler, G; Klein, SL; Old, S; Rasooly, R. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Research^[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334.
Wiemann S; Arlt D; Huber W; Wellenreuther, R; Schleeger, S; Mehrle, A; Bechtel, S; Sauermann, M; Korf, U. From ORFeome to Biology: A Functional Genomics Pipeline (англ.) // Genome Research^[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2136—2144. — doi:10.1101/gr.2576704. — PMID 15489336.
Voelter-Mahlknecht S., Ho A.D., Mahlknecht U. Chromosomal organization and localization of the novel class IV human histone deacetylase 11 gene (англ.) // International Journal of Molecular Medicine^[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 16, no. 4. — P. 589—598. — doi:10.3892/ijmm.16.4.589. — PMID 16142391.
Rual JF; Venkatesan K; Hao T; Hirozane-Kishikawa, Tomoko; Dricot, Amélie; Li, Ning; Berriz, Gabriel F.; Gibbons, Francis D.; Dreze, Matija. Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 437, no. 7062. — P. 1173—1178. — doi:10.1038/nature04209. — PMID 16189514.
Mehrle A; Rosenfelder H; Schupp I; Del Val, C; Arlt, D; Hahne, F; Bechtel, S; Simpson, J; Hofmann, O. The LIFEdb database in 2006 (англ.) // Nucleic Acids Research^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 34, no. Database issue. — P. D415—8. — doi:10.1093/nar/gkj139. — PMID 16381901.
Lindberg D., Akerström G., Westin G. Mutational analyses of WNT7A and HDAC11 as candidate tumour suppressor genes in sporadic malignant pancreatic endocrine tumours (англ.) // Clin. Endocrinol. (Oxf) : journal. — 2007. — Vol. 66, no. 1. — P. 110—114. — doi:10.1111/j.1365-2265.2006.02694.x. — PMID 17201809.

Ссылки

MeSH HDAC11+protein,+human

[pmid11948178-1] Gao L., Cueto M.A., Asselbergs F., Atadja P. Cloning and functional characterization of HDAC11, a novel member of the human histone deacetylase family (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — July (vol. 277, no. 28). — P. 25748—25755. — doi:10.1074/jbc.M111871200. — PMID 11948178.

[entrez-2] 2,0 ^2,1 Entrez Gene: HDAC11 histone deacetylase 11 (неопр.).

[autogenerated1-3] Gao, Lin; Cueto Maria A; Asselbergs Fred; Atadja Peter. Cloning and functional characterization of HDAC11, a novel member of the human histone deacetylase family (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — United States, 2002. — July (vol. 277, no. 28). — P. 25748—25755. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M111871200. — PMID 11948178.

[1]

[2]

[3]