Гистондеацетилаза 10

Гистондеацетилаза 10
Гистондеацетилаза 10
Идентификаторы
Символ	HDAC10 ; HD10
Внешние ID	OMIM: 608544 MGI: 2158340 HomoloGene: 23749 IUPHAR: ChEMBL: 5103 GeneCards: HDAC10 Gene
номер EC	3.5.1.98
Генная онтология
Генная онтология
Функция	• histone deacetylase activity; • protein binding; • enzyme binding; • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific); • protein deacetylase activity; • histone deacetylase binding; • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K9 specific); • NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific); • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K18 specific);
Компонент клетки	• histone deacetylase complex; • nucleus; • nucleoplasm; • cytoplasm;
Биологический процесс	• negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • transcription, DNA-templated; • regulation of transcription, DNA-templated; • protein deacetylation; • Notch signaling pathway; • oligodendrocyte development; • chromatin modification; • histone deacetylation; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • histone H3 deacetylation; • histone H4 deacetylation;
	Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи

Гистондеацетилаза 10 (англ. Histone deacetylase 10) — фермент, кодируемый у человека геном HDAC10 ^[1]^[2]^[3].

Ацетилирование ядра гистонов модулирует структуру хроматина и экспрессию генов. Противоположная ферментативная деятельность гистонов ацетилтрансфераз и гистондезацетилаз, таких как HDAC10, определяет статус ацетилирования гистонов (Као и др., 2002 г.)^[3].

Взаимодействия

HDAC10, как было выявлено, взаимодействует с HDAC2^[4] и NCOR2^[4].

См также

Деацетилазы гистонов

Примечания

↑ Kao H.Y., Lee C.H., Komarov A., Han C.C., Evans R.M. Isolation and characterization of mammalian HDAC10, a novel histone deacetylase (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — January (vol. 277, no. 1). — P. 187—193. — doi:10.1074/jbc.M108931200. — PMID 11677242.
↑ Guardiola A.R., Yao T.P. Molecular cloning and characterization of a novel histone deacetylase HDAC10 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — January (vol. 277, no. 5). — P. 3350—3356. — doi:10.1074/jbc.M109861200. — PMID 11726666.
↑ ^3,0 ^3,1 Entrez Gene: HDAC10 histone deacetylase 10 (неопр.).
↑ ^4,0 ^4,1 Fischer, Denise D; Cai Richard; Bhatia Umesh; Asselbergs Fred A M; Song Chuanzheng; Terry Robert; Trogani Nancy; Widmer Roland; Atadja Peter; Cohen Dalia. Isolation and characterization of a novel class II histone deacetylase, HDAC10 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — United States, 2002. — February (vol. 277, no. 8). — P. 6656—6666. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M108055200. — PMID 11739383.

Литература

Bonaldo M.F., Lennon G., Soares M.B. Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery (англ.) // Genome Research^[англ.] : journal. — 1997. — Vol. 6, no. 9. — P. 791—806. — doi:10.1101/gr.6.9.791. — PMID 8889548.
Dunham I; Shimizu N; Roe BA; Bruskiewich, R.; Beare, D. M.; Clamp, M.; Smink, L. J.; Ainscough, R.; Almeida, J. P. The DNA sequence of human chromosome 22 (англ.) // Nature. — 1999. — Vol. 402, no. 6761. — P. 489—495. — doi:10.1038/990031. — PMID 10591208.
Fischer DD; Cai R; Bhatia U; Asselbergs, FA; Song, C; Terry, R; Trogani, N; Widmer, R; Atadja, P. Isolation and characterization of a novel class II histone deacetylase, HDAC10 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 8. — P. 6656—6666. — doi:10.1074/jbc.M108055200. — PMID 11739383.
Tong J.J., Liu J., Bertos N.R., Yang X.J. Identification of HDAC10, a novel class II human histone deacetylase containing a leucine-rich domain (англ.) // Nucleic Acids Research^[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 30, no. 5. — P. 1114—1123. — doi:10.1093/nar/30.5.1114. — PMID 11861901.
Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; Derge, JG; Klausner, RD; Collins, FS; Wagner, L; Shenmen, CM; Schuler, G.D. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932.
Rodriguez M., Yu X., Chen J., Songyang Z. Phosphopeptide binding specificities of BRCA1 COOH-terminal (BRCT) domains (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2004. — Vol. 278, no. 52. — P. 52914—52918. — doi:10.1074/jbc.C300407200. — PMID 14578343.
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. An unappreciated role for RNA surveillance (англ.) // BioMed Central^[англ.]. — 2005. — Vol. 5, no. 2. — P. R8. — doi:10.1186/gb-2004-5-2-r8. — PMID 14759258.
Osada H; Tatematsu Y; Saito H; Yatabe, Yasushi; Mitsudomi, Tetsuya; Takahashi, Takashi. Reduced expression of class II histone deacetylase genes is associated with poor prognosis in lung cancer patients (англ.) // International Journal of Cancer^[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 112, no. 1. — P. 26—32. — doi:10.1002/ijc.20395. — PMID 15305372.
Collins JE; Wright CL; Edwards CA; Davis, Matthew P; Grinham, James A; Cole, Charlotte G; Goward, Melanie E; Aguado, Begoña; Mallya, Meera. A genome annotation-driven approach to cloning the human ORFeome (англ.) // BioMed Central^[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 5, no. 10. — P. R84. — doi:10.1186/gb-2004-5-10-r84. — PMID 15461802.
Gerhard DS; Wagner L; Feingold EA; Shenmen, CM; Grouse, LH; Schuler, G; Klein, SL; Old, S; Rasooly, R. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Research^[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334.

[pmid11677242-1] Kao H.Y., Lee C.H., Komarov A., Han C.C., Evans R.M. Isolation and characterization of mammalian HDAC10, a novel histone deacetylase (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — January (vol. 277, no. 1). — P. 187—193. — doi:10.1074/jbc.M108931200. — PMID 11677242.

[pmid11726666-2] Guardiola A.R., Yao T.P. Molecular cloning and characterization of a novel histone deacetylase HDAC10 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — January (vol. 277, no. 5). — P. 3350—3356. — doi:10.1074/jbc.M109861200. — PMID 11726666.

[entrez-3] 3,0 ^3,1 Entrez Gene: HDAC10 histone deacetylase 10 (неопр.).

[pmid11739383-4] 4,0 ^4,1 Fischer, Denise D; Cai Richard; Bhatia Umesh; Asselbergs Fred A M; Song Chuanzheng; Terry Robert; Trogani Nancy; Widmer Roland; Atadja Peter; Cohen Dalia. Isolation and characterization of a novel class II histone deacetylase, HDAC10 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — United States, 2002. — February (vol. 277, no. 8). — P. 6656—6666. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M108055200. — PMID 11739383.

[1]

[2]

[3]

[4]