10-я хромосома человека
Идеограмма 10-й хромосомы человека
10-я хромосо́ма челове́ка — одна из 46 хромосом человека. Содержит приблизительно 133 миллиона пар оснований и составляет от 4 % до 4,5 % клеточного материала ДНК.
Общее количество генов
Различные исследовательские группы используют разные подходы к аннотации генома, поэтому информация о количестве генов в различных базах данных по каждой хромосоме может отличаться между собой и меняться с течением времени. Ниже приведены некоторые оценки количества генов 10-й хромосомы человека:
| База данных | Гены, кодирующие белок | Гены, не кодирующие РНК | Псевдогены | Источник |
|---|---|---|---|---|
| Consensus CDS Project | 706 | - | - | [1] |
| HUGO Gene Nomenclature Committee | 708 | 244 | 614 | [2] |
| Ensembl genome database project | 728 | 881 | 568 | [3] |
| National Center for Biotechnology Information | 754 | 842 | 654 | [4] |
Гены
Ниже приведены некоторые известные гены, расположенные на 10-й хромосоме человека:
- ALOX5 — Арахидонат-5-липоксигеназа (превращает незаменимые жирные кислоты в лейкотриены, которые играют важную роль в воспалительной реакции; также способствует развитию и поддержанию раковых стволовых клеток, медленно делящихся клеток, которые, как считается, дают начало различным злокачественным опухолям);
- CDH23 — кадгеринподобный ген 23;
- CXCL12 — хемокин CXCL12, SDF-1, scyb12;
- EGR2 — англ. early growth response 2 (Krox-20 — гомолог у дрозофилы);
- ERCC6 — англ. excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6;
- FGFR2 — рецептор 2 фактора роста фибробластов;
- NRP1 — нейропилин 1;
- PCBD1 — птерин-4-альфа-карбиноламиндегидратаза;
- PCDH15 — протокадгерин 15;
- RET — протоонкоген RET;
- VIM — виментин, белок промежуточных филаментов;
- UROS — синтаза уропорфириногена III.
q-плечо
- ANK3 — анкирин 3;
- CYP21A1 — 17-альфа-гидроксилаза;
- GOT1 — аспартатаминотрансфераза 1, цитозольная;
- NFKB2 — белок из семейства NF-κB/Rel;
- NRG3 — нейрегулин 3;
- PTEN — фосфатаза PTEN, супрессор опухолей[5][6];
- XPNPEP1 — фермент, аминопептидаза P1.
p-плечо
- AKR1C1 — фермент метаболизма стероидов, альдокеторедуктаза;
- AKR1C3 — фермент синтеза стероидов, альдокеторедуктаза;
- GAD2 — ГАМК-производящий фермент глутаматдекарбоксилаза 2;
- ITGA8 — гликопротеин из надсемейства интегринов (альфа-8);
- ITGB1 — бета-1 интегрин.
- TUBB8 Тубулин Бета класс 8
Болезни и расстройства
- атрофия Gyrate (OAT)
- болезнь Рефсума (PAHX)
Примечания
- ↑ Search results - 10[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("has ccds"[Properties] AND alive[prop]) - Gene. NCBI (8 сентября 2016). Дата обращения: 15 января 2018.
- ↑ Statistics & Downloads for chromosome 10. HUGO Gene Nomenclature Committee (12 мая 2017). Дата обращения: 19 мая 2017.
- ↑ Chromosome 10: Chromosome summary - Homo sapiens. Ensembl Release 88 (29 марта 2017). Дата обращения: 19 мая 2017.
- ↑ Search results - 10[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene. NCBI (19 мая 2017). Дата обращения: 20 мая 2017.
- ↑ Li J., Yen C., Liaw D., Podsypanina K., Bose S., Wang S. I., Puc J., Miliaresis C., Rodgers L., McCombie R., Bigner S. H., Giovanella B. C., Ittmann M., Tycko B., Hibshoosh H., Wigler M. H., Parsons R. PTEN, a putative protein tyrosine phosphatase gene mutated in human brain, breast, and prostate cancer (англ.) // Science : journal. — 1997. — Vol. 275, no. 5308. — P. 1943—1947. — doi:10.1126/science.275.5308.1943. — PMID 9072974.
- ↑ Steck P. A., Pershouse M. A., Jasser S. A., Yung W. K., Lin H., Ligon A. H., Langford L. A., Baumgard M. L. , Hattier T., Davis T., Frye C., Hu R., Swedlund B., Teng D. H., Tavtigian S. V. Identification of a candidate tumour suppressor gene, MMAC1, at chromosome 10q23.3 that is mutated in multiple advanced cancers (англ.) // Nat Genet. : journal. — 1997. — Vol. 15, no. 4. — P. 356—362. — doi:10.1038/ng0497-356. — PMID 9090379.
