Гербарий Московского университета
| Гербарий Московского университета (Гербарий МГУ) | |
|---|---|
 Зал Гербария Московского университета | |
| Международное название | MW |
| Основан | 1765 |
| Директор | вакантно |
| Сотрудников | 7 |
| Расположение |
 Россия: Москва, Ленинские горы, д. 1, стр. 12, аудитории 401 и 501 |
| Сайт | https://plant.depo.msu.ru/ |
| Награды | Вики-премия «Свободные знания» (2018) |
Герба́рий Моско́вского университе́та (также — Гербарий и́мени Сыре́йщикова) — старейший и второй по величине гербарий России. Возник, вероятно, около 1765 года. Является структурным подразделением кафедры геоботаники биологического факультета МГУ.
Объём основных фондов — 1 030 669 образцов (на ноябрь 2017 года)[1], прирост фондов в 2016 году — 22 013 образцов. Имеет международный акроним MW. В основных фондах гербария хранятся образцы, принадлежащие 37 100 видам сосудистых растений и 2223 видам мохообразных [1].
Находится на 62-м месте по объёму фондов среди всех гербариев мира, на 24-м месте среди гербариев вузов.
В гербарии сосредоточены важнейшие коллекции по флоре средней полосы России, важные коллекции по флоре других регионов России, Кавказа, Средней Азии, Казахстана, Монголии, а также по мохообразным России; важные именные коллекции (Георга Гофмана, Фридриха Эрхарта, Карла Триниуса, отца и сына Форстеров, а также коллекции, имеющие отношение к Карлу Линнею).
В конце 2015 года в гербарии работало шестеро сотрудников и до 15 внештатных помощников [2]. В начале XXI века гербарий посещали более 50 посетителей в год[2].
![[2]](http://cs629116.vk.me/v629116577/38deb/z1cEtNNN3_s.jpg){kind=link}
В 2015 — 2017 гг. в рамках проекта Московского университета по созданию национального банка-депозитария живых систем осуществлена полная оцифровка (сканирование, создание базы данных) фондов Гербария. На конец 2017 года отсканированы и опубликованы в интернете сканы 911 тыс. образцов [3].
История
Коллекции
Коллекторы
Многие ботаники и естествоиспытатели передавали свои коллекции в Гербарий МГУ. Это прежде всего сотрудники и профессора Московского университета, его выпускники, а также видные учёные, пересылавшие дублеты своих сборов из других учреждений. Важнейшие коллекторы Гербария Московского университета, о которых имеются статьи в Википедии, перечислены ниже в алфавитном порядке:
- Алексеев, Евгений Борисович [4]
- Алёхин, Василий Васильевич [5]
- Анненков, Николай Иванович [6]
- Арнольди, Владимир Митрофанович [7]
- Артари, Александр Петрович [8]
- Баньковский, Лев Владимирович [9] (дублеты)
- Берг, Лев Семёнович [10]
- Варсанофьева, Вера Александровна [11]
- Воронов, Анатолий Георгиевич [12]
- Гептнер, Владимир Георгиевич [13]
- Говорухин, Василий Сергеевич [14]
- Голенкин, Михаил Ильич [15]
- Горожанкин, Иван Николаевич [16]
- Гроссет, Гуго Эдгарович [17]
- Губанов, Иван Алексеевич [18]
- Доктуровский, Владимир Семёнович [19]
- Еленевский, Андрей Георгиевич [20] (сборы с Кубы)
- Ена, Андрей Васильевич [21] (дублеты)
- Житков, Борис Михайлович [22]
- Зернов, Александр Сергеевич [23]
- Иконников, Сергей Сергеевич [24] (дублеты)
- Ильин, Модест Михайлович [25] (дублеты)
- Казанский, Николай Александрович [26]
- Камелин, Рудольф Владимирович [27] (дублеты)
- Каминг, Хью [28] (дублеты)
- Караваев, Михаил Николаевич [29]
- Кауфман, Николай Николаевич [30]
- Комаров, Владимир Леонтьевич [31] (дублеты)
- Красноборов, Иван Моисеевич [32] (дублеты)
- Кречетович, Лев Мельхиседекович [33]
- Куваев, Владимир Борисович [34]
- Кудряшов, Леонид Васильевич [35]
- Липшиц, Сергей Юльевич [36]
- Литвинов, Дмитрий Иванович [37]
- Мазуренко, Мая Тимофеевна [38] (дублеты)
- Максимович, Михаил Александрович [39]
- Малышев, Леонид Иванович [40] (ранние сборы)
- Муралевич, Вячеслав Степанович [41]
- Мяздриков, Иван Петрович [42]
- Назаров, Михаил Иванович [43]
- Нейштадт, Марк Ильич [44]
- Новиков, Владимир Сергеевич [45]
- Новопокровский, Иван Васильевич [46]
- Носков, Александр Куприянович [47]
- Павлов, Вадим Николаевич [48]
- Павлов, Николай Васильевич [49]
- Петунников, Алексей Николаевич [50]
- Пименов, Михаил Георгиевич [51]
- Портениер, Николай Николаевич [52] (дублеты)
- Работнов, Тихон Александрович [53]
- Серебряков, Иван Григорьевич [54] (ранние сборы)
- Серёгин, Алексей Петрович [55]
- Скворцов, Алексей Константинович [56] (ранние сборы)
- Смирнов, Павел Александрович (биолог) [57]
- Соколов, Дмитрий Дмитриевич [58]
- Станков, Сергей Сергеевич [59]
- Старобогатов, Ярослав Игоревич [60]
- Сукачёв, Владимир Николаевич [61]
- Сырейщиков, Дмитрий Петрович [62]
- Сюзев, Павел Васильевич [63] (дублеты)
- Тихомиров, Вадим Николаевич [64]
- Трофимов, Тит Трофимович [65]
- Турчанинов, Николай Степанович [66] (дублеты)
- Тыртиков, Алексей Павлович [67]
- Тюремнов, Сергей Николаевич [68]
- Уранов, Алексей Александрович [69] (ранние сборы)
- Флёров, Александр Фёдорович [70]
- Формозов, Александр Николаевич [71]
- Харкевич, Сигизмунд Семёнович [72] (дублеты)
- Хохряков, Андрей Павлович [73] (дублеты)
- Цвелёв, Николай Николаевич [74] (дублеты)
- Цейгер, Карл Людвиг Филипп [75] (дублеты)
- Цингер, Василий Яковлевич [76]
- Чистяков, Иван Дорофеевич [77]
- Шретер, Алексей Иванович [78]
- Щукин, Иван Семёнович [79]
- Эклон, Христиан Фредерик [80] (дублеты)
- Юнатов, Александр Афанасьевич [81]
- Юрцев, Борис Александрович [82] (ранние сборы)
- Ярошенко, Павел Дионисьевич [83] (дублеты)
Научная деятельность
Исходя из размеров и научной деятельности того или иного гербария, за ними закрепляется право определенного количества голосов на Номенклатурной секции Международного ботанического конгресса. Цель заседаний Номенклатурной секции — внесение текущих изменений в Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений. На Конгрессе в Шэньчжэне (июль 2017 г.) за российскими Гербариями закреплено 24 голоса из 926, в т.ч. три голоса за Гербарием МГУ [3]. Это на один голос больше, чем в 2011 году.
Оцифровка коллекций
Ранее, в конце 1990-х — начале 2000-х гг. при поддержке РФФИ (грант № 98-07-91048э) было отсканировано и размещено в Интернете (http://herba.msu.ru/pictures/mw_type/index.html) около 600 изображений типов гербария МГУ. Кроме того, 63 образца были изданы на CD «Herbarium Linnaeanum». С тех пор работы по оцифровке не получали специального финансирования и были приостановлены.
В рамках комплексной программы «Научные основы создания Национального банка-депозитария живых систем» (грант РНФ № 14-50-00029) по направлению «Растения» Гербарий МГУ получил финансирование на оцифровку коллекций. Коллектив гербария задался целью за три года перевести в цифровой вид и представить в Интернете около 1 млн образцов из фондов гербария МГУ. Согласно приоритетам РНФ (Арктика, Дальний Восток), в качестве пилотных объектов по оцифровке фондов в 2015 г. были выбраны отделы Сибири — Дальнего Востока и Восточной Европы. В 2005 г. сотрудниками были подведены итоги инвентаризации фондов Гербария, занявшей более 10 лет. В последующие годы табличная база данных ежегодно актуализировалась, в ней учитывались новые включения и переопределения. Перед началом работ по оцифровке была выполнена работа по верификации содержательной части базы по сосудистым растениям [84].
Каждый из образцов до сканирования проходил через несколько процедур, необходимых для получения информативных изображений. На каждый лист был наклеен штрихкод международного стандарта с уникальным идентификатором образца. Далее у каждого образца открывалась этикетка (если она была закрыта растением или сложена), важные отломанные фрагменты растений прикреплялись к образцу, проверялось наличие ярлыков с переопределениями и порядок расположения фондового материала. В редких случаях приходилось заменять ветхие обложки, исправлять указатели, размещать образцы мелкого формата на стандартных листах монтировочной бумаги, повторно проверять номенклатуру. Всего в этой работе (вместе с помощниками) принимало участие 65 человек.
Сканирование коллекции велось силами компании-партнера. Этот процесс осуществлялся согласно техническому заданию со следующими основными параметрами изображений. Основное изображение: формат TIFF, 300 dpi; размер файла до 60 MB; массив свыше 30TB. Копия: формат JPG, 300 dpi; сжатие 80 %; размер файла до 2,5 MB; массив около 1,5 TB. Этапы машинной обработки включали: разворот на 90 градусов, обрезку чёрного поля, доворот до прямого угла, распознавание штрихкода, создание JPG-копии [85].
Научной группой осуществлялась выдача материала на сканирование, обратное вкладывание образцов в обложки, проверка комплектности, возврат в места постоянного хранения. Кроме того, при необходимости выполнялась внеплановая работа: проверка качества изображений после калибровки сканеров; поиск и выдача образцов, отсканированных с физическим браком; поиск образцов с пропущенными штрихкодами; поиск пропущенных образцов; проверка списков папок, отсутствовавших в БД; проверка дублированных файлов.
Созданная в 2015 г. коллекция изображений отсканированных гербарных образцов из фондов гербария МГУ насчитывала сканы 502 тыс. образцов, из которых 156 тыс. из отдела Сибири — Дальнего Востока и 346 тыс. из отдела Восточной Европы [86].
В 2016 году отсканированы отделы Кавказа, Крыма, Монголии, Зарубежной Азии, Herbarium Alchemillarum и типовые образцы (около 215 000 образцов), а также этикетки с конвертов гербария мхов (73 тыс. образцов) [87].
В 2017 году отсканированы отделы Средней Азии и Казахстана (96 000 образцов), Америки (12 000 образцов), а также этикетки с конвертов гербария печеночников (4 тыс. образцов) и новые включения [88].
В 2018 году отсканированы отделы Западной Европы (40 000 образцов), Австралии и Океании (3 300 образцов), а также новые включения. В начале ноября 2018 года работы по оцифровке коллекции полностью завершены [89].
Цифровой гербарий МГУ
В результате оцифровки фондов в 2015—2017 гг. объём Цифрового гербария МГУ на 1 января 2018 года составил 911 тысяч образцов [90]. По результатам трёх лет проекта Гербарий МГУ занимает восьмое место в мире по объёмам оцифрованных и опубликованных в интернете фондов (уступает гербариям P, L, NY, PE, US, BR, MEXU) [91]. Он обладает крупнейшими оцифрованными коллекциями по флоре России, Украины, Белоруссии, Молдавии, Казахстана, Латвии, государств Закавказья (кроме Армении), Монголии, Казахстана и четырёх республик Средней Азии [92]. Кроме того, это вторая по величине точка доступа к оцифрованным гербарным образцам из Армении, Литвы, КНДР, Мали и третья для Кипра и Вьетнама.
Публикация отсканированных образцов ведется через двуязычный портал Национального банка-депозитария живых систем (доступны как публичная [93], так и операционная [94] версии). На 1 января 2018 года на портале содержались отсканированные изображения 910 820 гербарных образцов, принадлежащих к 35 615 видам сосудистых растений и мхов [95].
Идет работа по наполнению Цифрового гербария МГУ полными метаданными отсканированных образцов, которые включают текст оригинальных этикеток и географические координаты мест сбора каждого образца. Эта работа осуществляется с привлечением волонтёров [96]. На 7 ноября 2018 года географические привязки доступны для 288 751 образцов, для 122 906 образцов в базу данных внесён полный текст этикеток, а ещё для 339 396 образцов отдельные элементы этикеток распознаны автоматически с помощью OCR [97]. С октября 2017 года геопривязка образцов осуществляется с использованием разработанной системы «ИСТРА» (Интеллектуальная Система Топонимического Распознавания и Атрибутирования), которая автоматически привязывает образцы растений к географической точке [98].
Цифровой гербарий МГУ — крупнейший донор информации о биоразнообразии России для Global Biodiversity Information Facility (GBIF) [99], международной платформы-агрегатора пространственных биологических данных. Информация о гербарных образцах из Московского университета составляет 65 % от общего объёма электронных данных, опубликованных на GBIF российскими учреждениями, и 23 % от всех имеющихся на GBIF данных о биоразнообразии России [100], [101].
Атлас флоры России
На платформе iNaturalist сотрудниками Гербария МГУ организован сбор данных по флоре России на основе принципов «гражданской науки» [102]. Это проект «Флора России». Любой пользователь может загрузить фотографию растения и отметить точку съёмки на карте. После проверки определения данные получают «исследовательский уровень» и также экспортируются в GBIF. Проект был запущен в середине января 2019 года как соревнование между региональными командами [103]. За первый месяц он привлёк более тысячи участников, а число загруженных наблюдений превысило 30 тысяч [104].
В конце октября 2019 года на «Флоре России» было уже более 200 тысяч изображений, выложенных 3670 участниками[4].
Примерно пятая часть изображений на «Флоре России» остается под несвободной лицензией. По состоянию на декабрь 2019 года под свободной лицензией были 225 885 изображений от 3832 человек, а под несвободными лицензиями оставались 45 722 изображений (20,2 % от общего числа загруженных) от 2258 пользователей[5].
В платформу встроено автоматическое распознавание растений на основе нейросети. Каждая загруженная фотография после проверки определения экспертами используется для обучения системы, что вкупе с пространственными данными о распространении растений позволяет совершенствовать алгоритмы машинного определения [105].
Информация для посетителей
Гербарий Московского университета открыт для профессиональных ботаников, ведущих научные исследования, с понедельника по пятницу с 9 до 17 часов без предварительного уведомления. Гербарий расположен в биолого-почвенном корпусе МГУ в аудиториях 401 и 501. Сотрудники Гербария, по предварительному согласованию, устраивают ознакомительные экскурсии для непрофессиональных посетителей[1].
Заведующий Гербарием в 2017 году — член-корреспондент РАН, заслуженный профессор МГУ, доктор биологических наук Вадим Николаевич Павлов[1].
Гербарий постоянно привлекает к работе волонтёров, имеющих начальные познания в ботанике [106], [107].
С лета 2017 года в Гербарии МГУ открыта конкурсная программа трёх-шестимесячных стажировок для аспирантов российских организаций [108], [109]. Осенью 2017 года открыта программа бесплатных стажировок по программе менторства для студентов естественных факультетов московских вузов [110]
См. также
- Гербарий
- Список крупнейших гербариев мира
- Список гербариев России
- Московский государственный университет
- Биологический факультет МГУ
- Зоологический музей Московского государственного университета
- Ботанический сад биологического факультета МГУ
- Аптекарский огород
- Флора России (интернет-проект)
Ссылки
Примечания
- ↑ 1,0 1,1 1,2 Herbarium Details: Moscow State University (англ.). Index Herbariorum. International Plant Science Center; The New York Botanical Garden (Dec 2010). Дата обращения: 15 октября 2014. Архивировано 23 марта 2012 года.
- ↑ Коллекции. depo.msu.ru. Дата обращения: 8 февраля 2018. Архивировано 8 февраля 2018 года.
- ↑ Архивированная копия (недоступная ссылка). Дата обращения: 15 марта 2020. Архивировано 2 февраля 2017 года.
- ↑ Наука и жизнь. — 2019. — № 12. — С. 22.
- ↑ Россия vs. Мексика на iNaturalist.org: остался последний рывок!